从单细胞测序到PCF80:CAFs研究如何补充空间蛋白证据?

📅 2026/6/30 11:35:42
从单细胞测序到PCF80:CAFs研究如何补充空间蛋白证据?
单细胞测序让癌症相关成纤维细胞CAFs研究进入了亚群时代myCAF、iCAF、apCAF以及更多新型CAF状态不断被提出。但许多团队在完成单细胞分析后会遇到一个后续问题这些转录亚群在真实组织中到底在哪里它们是否真的靠近肿瘤细胞、血管、TLS或免疫抑制细胞群它们的蛋白表达是否与转录结果一致PCF80作为基于80抗体Panel的空间单细胞蛋白组方案适合承担这一步“空间蛋白验证”的任务。它不是替代单细胞测序而是在组织原位把CAFs亚群放回肿瘤微环境中观察。《Nature Cancer》综述明确指出单细胞和空间多组学技术共同推动了CAFs异质性研究。单细胞测序在解析转录水平异质性方面具有优势能够发现不同CAFs亚群及其潜在功能但由于组织需要消化空间位置、局部邻域和细胞互作结构会被打散。对于CAFs这类强烈依赖微环境信号塑造的细胞缺少空间信息会影响对功能的理解。研究还提醒CAFs标志物存在癌种差异和交叉表达因此单一技术很难完整回答CAFs分型、功能和生态位之间的关系。PCF80可以作为单细胞测序之后的补充环节。研究者可先利用单细胞测序提出候选CAFs亚群和关键marker再将这些marker转化为空间蛋白Panel的一部分与免疫细胞、肿瘤细胞、血管和ECM指标一同检测。通过单细胞级别的空间蛋白图谱研究者可以验证某一CAF亚群是否位于肿瘤边缘、是否与T细胞排斥区域重叠、是否靠近血管周围髓系细胞或者是否与TLS结构中的B细胞、CD4 T细胞呈现共定位趋势。这种互补关系有助于让转录发现更接近组织真实场景。这种“单细胞发现PCF80空间验证”的思路适合多类研究。比如胰腺癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌等实体瘤中CAFs亚群的空间分布比较免疫检查点抑制剂响应与非响应样本中CAFs邻域差异分析化疗或靶向治疗后CAFs状态重塑研究转移灶与原发灶CAFs生态位差异研究以及围绕TGFβ、IL-6、ECM、MHC II/CD74等轴线展开的机制假设验证。对于有FFPE样本资源的队列PCF80还可以帮助把已有单细胞结论延伸到更多组织样本的原位层面。从研究路径看CAFs领域已经不再满足于“测出一个亚群”而是需要知道这个亚群是否在组织中形成稳定生态位。单细胞测序提供发现线索PCF80提供空间蛋白证据两者结合可以形成更完整的研究闭环。需要强调的是PCF80输出的是科研数据和空间分析结果不能被表述为临床诊断或治疗结论。它的真正价值在于补齐单细胞测序缺失的组织位置信息帮助研究者从细胞分型走向微环境结构解析。文献参考Pramod S, Lavon H, Scherz-Shouval R, Sherman MH. Heterogeneity and plasticity of cancer-associated fibroblasts. Nat Cancer. 2026. https://doi.org/10.1038/s43018-026-01146-x