伯远生物是国家级专精特新小巨人企业农业农村部生物育种重点实验室牵头多项省部级重大专项公司科研技术人员500硕博占比40%以上是国内最大植物功能基因研究综合性平台15年技术沉淀每年完成功能基因研究数量50000长期服务课题组10000含清北、复旦、武大、华科等知名高校及所有农业类科研院所服务头部种业公司客户300余家涉及四十多个物种含水稻、玉米、小麦、马铃薯、大豆五大主粮以及禾本科高粱、甘蔗葫芦科黄瓜、西甜瓜茄科番茄、辣椒与十字花科等100多个品种的50多个性状含抗虫抗病、抗除草剂、品质提升、株型改良等各类仪器设备投资超1个亿高标准恒温繁育基地200亩案例展示图 CUTTag技术鉴定全基因组范围内GhLYI结合位点Zhang et al., 2023。参考文献1.Kaya-Okur H S, Wu S J, Codomo C A, et al. CUTTag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells.Nat. Commun. 10, 1930[J]. 2019.2.Zhang Y, Zang Y, Chen J, et al. A truncated ETHYLENE INSENSITIVE3-like protein, GhLYI, regulates senescence in cotton[J].Plant Physiology,2023, 193(2): 1177-1196.背景说明CUTTag技术的核心是在Tn5上融合了protein A/G抗体结合功能域的转座体pAG-Tn5。在进行CUTTag实验时首先进行靶蛋白特异性抗体一抗孵育使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号同理接着进行二抗孵育。最后孵育pAG-Tn5转座体使得转座体进入细胞并与抗体结合这样就把转座体间接的固定在靶蛋白上随后加入Mg2激活Tn5酶的切割活性切断靶蛋白结合的DNA区域。由于Tn5连有测序接头在打断的同时直接在片段化的DNA上加接头接着提取DNA进行PCR扩增构建文库。该技术克服了ChIP-seq需要的样本细胞量大需要经过甲醛交联、超声物理性打断等步骤由于未对细胞核和染色质进行物理性的破坏整个操作过程相当“温和”因此CUTTag的背景噪音数据非常少对起始细胞量的要求大幅减少且数据可重复性好。图 CUTTag技术原理图Kaya-Okur et al., 2019。服务流程订单/实验材料确认——样品前处理——抗体孵育——Protein A/G-Transposome孵育——转座子激活——DNA片段化——DNA提取——文库扩增与纯化——高通量测序——数据分析——结果交付服务内容及说明技术应用1、用于表观遗传学领域的蛋白质与DNA互作研究2、研究转录因子在全基因组上的结合或分布位点3、研究组蛋白修饰在全基因组上的分布位点4、寻找转录因子下游调控的靶基因。